O reconhecimento e consequente recomendação são concedidos pelo Conselho Técnico-Científico da Educação Superior (CTC-ES) e levam em consideração os seguintes quesitos:
- Proposta do Programa
- Corpo Docente
- Corpo discente, teses e dissertações
- Produção Intelectual
- Inserção Social
Os programas de Mestrado em Engenharia Mecânica, Mestrado em Engenharia Elétrica e Mestrado em Administração do Centro Universitário da FEI são reconhecidos e recomendados pela CAPES com nota 3.